Identificación de genotipos estables en 19 familias de Prosopis alba usando marcadores de microsatélites y parámetros de productividad = Identifying stable genotypes in 19 families of Prosopis alba using microsatellite markers and productivity parameters

Se caracterizaron mediante marcadores moleculares y morfométricos diecinueve familias de algarrobo blanco, de la colección a campo de Prosopis establecida en el año 2010, pertenecientes al banco de germoplasma INTA-Sáenz Peña, seleccionando la procedencia Río Bermejito (Departamento General Güemes, Chaco) por su estabilidad genética. La investigación fue conducida en la EEA (Estación Experimental Agropecuaria) INTA (Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria), Sáenz Peña (Latitud Sur 26º 47' 27" y Longitud Oeste 60º 26' 29"; Altitud 90 m s.n.m.), Chaco. Durante 2014-2016. Se realizó la caracterización molecular con catorce marcadores microsatélites (SSRs) y la caracterización morfológica se llevó a cabo analizando distintas variables morfométricas. Al estudiar la similitud genética entre las diecinueve familias se observó que las progenies se relacionaron en un solo grupo con un 45 % de similitud sin agruparse por familia. El estudio de la diversidad genética reveló una frecuencia alélica similar entre las familias. Además, el valor de la heterocigosidad esperada (He) resultó más baja que la heterocigosidad observada (Ho) indicando endogamia. El AMOVA y los estadísticos F de Wright evidenciaron que la mayor diferenciación genética se encuentra dentro de cada familia y es menor entre familias. La plantación presenta un distanciamiento de 4 m x 4 m con cuatro (4) pseudorepeticiones por familia. Se aplicó un análisis estadístico descriptivo y un análisis de la variancia no paramétrico Kruskal Wallis al 5 %, ambos mostraron que no existen diferencias significativas entre las familias, siendo la altura total el parámetro más estable. Este estudio permitirá un primer paso en la selección de genotipos estables para mejoramiento genético convencional.Nineteen (19) white carob families from Rio Bermejito (General Güemes Department in the Province of Chaco) belonging to the field collection of Prosopis established in 2010 were selected from the INTA-Saenz Peña germplasm bank due to their genetic stability and characterized by molecular and morphometric markers. This work was conducted in the Agricultural Experimental Station (EEA in Spanish) of the National Institute of Agricultural Technology (INTA in Spanish) located in Sáenz Peña (Latitude South 26º47'27" and West Length 60º26'29", Altitude 90 msn), Chaco during 2014-2016. The molecular characterization was performed using fourteen microsatellite markers (SSR) while the morphological one was carried out by analyzing different morphometric variables. When studying the genetic similarity among the 19 families, the progenies were related into a single group showing 45% of similarity without being grouped by family. The study of genetic diversity revealed similar frequency between families. Furthermore, the expected value for heterozygosity (He) was lower than the observed (Ho) which indicates inbreeding. The AMOVA and the Wright’s F statistical showed that the greatest genetic differentiation occurs within each family and it is lower among families. There is a 4 x 4 distancing in the plantation with four (4) pseudo-repetitions per family. The descriptive statistical analysis together with the nonparametric Kruskal Wallis at 5% of variance were both applied; both showed nonsignificant differences among families, being total height the most stable parameter. This study will allow a first step in the selection of stable genotypes for conventional breeding improvement be taken.EEA Sáenz PeñaFil: Klein, Lorena Marina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Sáenz Peña; ArgentinaFil: Spoljaric, Mónica. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Sáenz Peña; ArgentinaFil: Torales, Susana Leonor. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; Argentin

Transcriptome survey of Patagonian southern beech Nothofagus nervosa (= N. Alpina): assembly, annotation and molecular marker discovery

Nothofagus nervosa is one of the most emblematic native tree species of Patagonian temperate forests. Here, the shotgun RNA-sequencing (RNA-Seq) of the transcriptome of N. nervosa, including de novo assembly, functional annotation, and in silico discovery of potential molecular markers to support population and associations genetic studies, are described.Fil: Torales, Susana Leonor. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Rivarola, Maximo Lisandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Pomponio, Maria Florencia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Fernandez, Paula Del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Acuña, Cintia Vanesa. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Marchelli, Paula Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. ArgentinaFil: Gonzalez, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Azpilicueta, María M. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. ArgentinaFil: Hopp, Horacio Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Gallo, Leonardo A. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. ArgentinaFil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Marcucci Poltri, Susana Noemi. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentin

Identification of single nucleotide polymorphisms [SNPs] at candidate genes involved in abiotic stress in two Prosopis species and hybrids

Aim of the study: Identify and compare SNPs on candidate genes related to abiotic stress in Prosopis chilensis, Prosopis flexuosa and interspecific hybrids Area of the study: Chaco árido, Argentina. Material and Methods: Fragments from 6 candidate genes were sequenced in 60 genotypes. DNA polymorphisms were analyzed. Main Results: The analysis revealed that the hybrids had the highest rate of polymorphism, followed by P. flexuosa and P. chilensis, the values found are comparable to other forest tree species. Research highlights: This approach will help to study genetic diversity variation on natural populations for assessing the effects of environmental changes.Fil: Marcucci Poltri, Susana Noemi. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Lopez Lauenstein, Diego. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; ArgentinaFil: Torales, Susana Leonor. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Pomponio, Maria Florencia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; Argentin

Desarrollo de marcadores moleculares microsatélites derivados del trascriptoma foliar de Cordia trichotoma (Vell.) Arráb. ex Steud.

Cordia trichotoma comúnmente conocido como “petiribí” o “afata” es un árbol nativo de alto valor debido a la calidad de su madera. En Argentina, se encuentra distribuido en la selva de Yungas (NOA) y en la Selva Paranaense (NEA) donde está sujeto a un aprovechamiento forestal de carácter extractivo y selectivo, lo que ha generado un estado de alto riesgo para la especie. El estudio de la variabilidad genética a través de marcadores moleculares permite determinar el estado de fragmentación y degradación de las poblaciones, identificación clonal o acortar tiempos en los programas de mejora basados en la selección fenotípica. Si bien en otras especies del género Cordia se han desarrollado marcadores microsatélites (SSR), en C. trichotoma, la falta de información genética ha sido una limitante para esta clase de estudios. Este trabajo tiene como objetivo el desarrollo de marcadores moleculares SSR a partir de las secuencias obtenidas del transcriptoma foliar de C. trichotoma con el fin de incluir nuevos marcadores moleculares que complementen los métodos de manejo y mejoramiento tradicionales y avanzar en el conocimiento genético para su conservación y producción sustentable.Fil: Pomponio, María Florencia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Fornes, Luis Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Soldati, María Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Torales, Susana Leonor. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; Argentin

Genetic variability of Araucaria angustifolia in the Argentinean Parana Forest and implications for management and conservation

The main forces shaping genetic variability of woody species in fragmented forest are the geographical distribution and demographic history of populations. We conducted molecular analyses to evaluate how these factors have affected Araucaria angustifolia genetic variability in the Argentinean Parana Forest and to identify valuable gene pools for conservation and management purposes. Using 706 polymorphic AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) markers, we analyzed nine native populations with different logging history and one plantation (312 individuals) of an uncertain origin. Average genetic diversity for the native populations was moderate-to-low (He = 0.128) in accordance with their marginal location within Araucaria’s range. In general, genetic diversity of populations decreases from east to west with increasing distances from the main area of species distribution on southern Brazil. Logging may have been responsible for further reduction of genetic variability in the more intensely exploited populations of the southern region and in some private fields. The moderate genetic differentiation among populations (ΦPT = 0.080) suggests an increase in the genetic structure of remnant populations because of fragmentation. UPGMA and Bayesian analyses agreed with the geographic location of populations. Populations from the southern Provincial Parks at Araucaria’s range edges grouped and differed genetically more from other populations. The highest genetic diversity of the plantation (He = 0.155) suggests that its individuals could have originated from seeds collected from different and/or highly variable sources of Brazil and the northeast of Argentina.Instituto de Recursos BiológicosFil: Inza, Maria Virginia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Aguirre, Natalia Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Torales, Susana Leonor. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Pahr, Norberto Manuel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Fassola, Hugo Enrique. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Fornes, Luis Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Zelener, Noga. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Recursos Biológicos; Argentin